Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddr1Q03146 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms