Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhlh1Q02576 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms