Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcqQ02111 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms