Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms