Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbp1Q01514 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms