Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms