Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms