Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms