Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neo1P97798 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neo1P97798 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms