Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms