Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cux2P70298 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cux2P70298 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cux2P70298 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms