Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sycp3P70281 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms