Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms