Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfixP70257 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfixP70257 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfixP70257 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfixP70257 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfixP70257 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfixP70257 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfixP70257 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfixP70257 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfixP70257 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfixP70257 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfixP70257 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NfixP70257 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms