Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps5P59438 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms