Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms