Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Setd4P58467 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Setd4P58467 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms