Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TdgP56581 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TdgP56581 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TdgP56581 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TdgP56581 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TdgP56581 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms