Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Map3k1P53349 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms