Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms