Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upp1P52624 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upp1P52624 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms