Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpdP50404 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SftpdP50404 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SftpdP50404 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms