Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Epb41P48193 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Epb41P48193 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Epb41P48193 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Epb41P48193 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Epb41P48193 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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