Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NodalP43021 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NodalP43021 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NodalP43021 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NodalP43021 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NodalP43021 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NodalP43021 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NodalP43021 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NodalP43021 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NodalP43021 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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