Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chd1P40201 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chd1P40201 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chd1P40201 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms