Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf1P39428 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms