Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin1P35438 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grin1P35438 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grin1P35438 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin1P35438 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms