Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptk2P34152 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms