Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psmb9P28076 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Psmb9P28076 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms