Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RarbP22605 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RarbP22605 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RarbP22605 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RarbP22605 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms