Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3P21107 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms