Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prim1P20664 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms