Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Fcer1aP20489 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fcer1aP20489 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Fcer1aP20489 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Fcer1aP20489 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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