Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VimP20152 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VimP20152 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VimP20152 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VimP20152 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VimP20152 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VimP20152 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VimP20152 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VimP20152 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VimP20152 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VimP20152 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VimP20152 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms