Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a1P19437 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms