Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl9P18340 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl9P18340 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms