Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54P14576 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms