Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms