Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb1P13372 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms