Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calb1P12658 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calb1P12658 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calb1P12658 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calb1P12658 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms