Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Schip1P0DPB4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms