Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csf1P07141 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csf1P07141 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms