Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53P02340 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms