Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01647 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01647 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01647 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01647 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms