Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01645 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01645 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01645 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01645 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01645 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms