Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01644 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01644 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01644 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01644 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01644 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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