Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JtbO88824 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JtbO88824 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms