Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn2O88703 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms