Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh7O88451 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh7O88451 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms