Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sorl1O88307 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms